Il est né en 1540 à Fontenay-le-Comte, capitale du Bas-Poitou à partir de 1544.

De 1555 à 1560, il étudie le droit à l'Université de Poitiers, dont il sort bachelier ès lois.

 

De 1560 à 1570, il occupe le siège d'avocat du roi au Tribunal de Fontenay-le-Comte.

Il se marie avec Barbe Cothereau dont il a une fille Jeanne .

 

De 1564  à 1570 Il est au service de la famille protestante de Soubise.Il est le secrétaire, biographe du Comte Jean de Parthenay l'Archevêque, et précepteur de sa fille Catherine. Il compose son Canon mathématique.

Il séjourne au Parc Soubise (près des Herbiers en Vendée )puis  va à Lyon avec Jean de Parthenay en 1564  et y rencontre le roi Charles IX. Il écrit les Mémoires de Jean de Parthenay l'Archevêque (qui meurt le 11 septembre 1566) et fait la généalogie de la maison de Parthenay-Lusignan 1566-1567. Il assiste au mariage de Catherine de Parthenay le 15 juin 1568 et suit Antoinette d'Aubeterre qui se sépare de sa fille et s'installe à La Rochelle, capitale du parti huguenot, où il y rencontre les chefs protestants Condé, Coligny, Jeanne d'Albret et son fils Henri de Navarre.

 

De 1571 à 1573 Il devient avocat au Parlement de Paris. Il commence à faire imprimer son Canon mathématique qui est édité à Paris en 1579.

Il sera présent lors de la nuit de la Saint-Barthélémy, durant laquelle fut tué le mari de Catherine de Parthenay, elle-même échappant de peu au massacre. Il est dénommé Sieur de la Bigotière après la mort de son père .

 

De 1574  à 1580 il devient conseiller au Parlement de Bretagne (Rennes). Il est ensuite reçu conseiller le 6 avril 1574, sur proposition du roi Charles IX (lettres patentes du 24 octobre 1573). Il participe uniquement à la session d'été (août-septembre-octobre), mais cependant il fut souvent absent et excusé par le roi Henri III pour les diverses missions que celui-ci lui confia en tant qu'ami et conseiller en sa Cour (cf. lettres patentes du 26 juillet 1579). Il séjourne toujours chez Catherine de Parthenay et sa mère à La Rochelle, chez Françoise de Rohan dans ses domaines de Beauvoir-sur-mer et de la Garnache (en Vendée, près de Challans). Il réside en 1577 à Beauvoir-sur-mer (Vendée) où il possède une maison.

Le 28 mars 1580 , il est nommé par Henri III, Maître des Requêtes ordinaire de l'Hôtel du Roi (charge à vie).

De 1584  à 1589 il est suspendu de ses fonctions par Henri III, sous la pression des Guise et des Nemours, chefs catholiques de la Sainte Ligue. il s'installe alors en Poitou et se consacre à ses travaux mathématiques. Il y rédige notamment son œuvre majeure l'Art analytique.

Réside de 1584 à 1585 au château de la Garnache, puis au parc Soubise, à Fontenay ou dans son domaine de la Bigotière.

 

De 1589 à 1593  il  reprend, après la mort de Henri III et grâce à l'avènement de Henri IV, ses fonctions de Maître des Requêtes et de conseiller auprès du roi et de la Cour installés provisoirement à Tours. Il Réside à Tours rue Traversayne. Il est à Fontenay en décembre 1589 pour des raveaux de cryptographie : il déchiffre les messages ennemis, en particulier ceux des Espagnols. Il faillit être condamné par Rome comme sorcier et nécromant car ces messages étaient réputés indécryptables.

 

De 1591 à 1593, il se  dispute à Tours, avec l'Humaniste et mathématicien Joseph Scaliger.

Il fait éditer à Tours, entre 1591 et 1593,  plusieurs opuscules de son Art analytique, et en 1593 d'un livre donnant des réponses à diverses questions mathématiques, objet de sa dispute avec Scaliger. Il publiera également deux opuscules en 1594 et 1595 pour rectifier les erreurs mathématiques commises par Scaliger dans un ouvrage qu'il venait de publier.

 

En 1594, il revient à Paris avec Henri IV, et est nommé conseiller du roi en son conseil privé.

 

Le 10 octobre 1594 il relève le défi de résoudre un problème proposé à "tous les mathématiciens du monde entier" par le mathématicien belge Adrien Romain, et fait éditer sa réponse en 1595.

 

En 1595 , il reçoit, à Fontenay, la visite d'Adrien Romain durant 5 à 6 semaines, pendant lesquelles les deux hommes font des mathématiques. Adrien Romain repart en Allemagne avec un problème à résoudre. Viète publiera sa propre solution en 1600 sous le titre : Apollonius Gallus.

 

En 1597 il est chargé par Henri IV de la mise en place du rachat des charges de notaires, et est nommé commissaire pour la Généralité du Poitou (comprenant l'Angoumois, La Rochelle et l'Aunis) pour l'exécution de cette tâche. Il profite de son temps libre pour continuer ses travaux mathématiques.

 

En 1600, il publie, sous forme de livre, un rapport sur le vrai calendrier grégorien, qui est condamné par Rome, ce qui l'entraîne dans une polémique avec Clavius, jésuite et mathématicien du Collège romain, chargé par le Pape, en 1582, de la réforme du calendrier.

Il séjourne à Tours en décembre 1601.

 

Le 14 décembre 1602, il obtient du roi, pour raison de santé, la résiliation de ses tâches. En 23 février 1603, il meurt à Paris.